Bendera kebangsaan pertama Peru diciptakan pada tahun 1820, ketika José de San Martín tiba dengan pasukannya dari Andes dari Argentina dan Chile. Bendera Peru yang dirancangnya menggabungkan warna merah dan putih, dikatakan telah dipilih kerana San Martín melihat sekawanan flamingo bersayap ketika kedatangannya. Bentuk bendera itu tidak biasa — pembahagian pepenjuru yang membentuk dua segitiga putih dan merah dengan lambang di tengahnya. Ketika partisan kemerdekaan tempatan menubuhkan diri, bendera lain diadopsi pada 15 Mac 1822. Kemiripan bendera ini (garis-garis mendatar merah-putih-merah yang sama dengan matahari merah, lambang tradisional kerajaan Inca, di tengahnya) untuk itu dari Sepanyol menimbulkan kekeliruan, dan segera diubah (31 Mei) menjadi bendera dengan garis menegak, tetapi lambang matahari tetap berada di tengah.

Kuiz Amerika Selatan: Fakta atau Fiksyen? Sebahagian besar pantai barat Amerika Selatan sangat kering.

Pada 25 Februari 1825, reka bentuk yang sekarang digunakan telah dibuat. Jalur menegak merah-putih-merah dari bendera sebelumnya dikekalkan, tetapi matahari digantikan oleh lambang baru. Perisainya dibingkai oleh satu karangan bunga (dari ranting sawit dan laurel) dan diatasi oleh yang lain. Perisai terbahagi kepada tiga bahagian dengan angka yang melambangkan kebanggaan dan kekayaan negara. Vicuña, unta berkeliaran bebas yang berkait rapat dengan llama dan alpaca, diwakili pada suku pertama; selain mewakili kekayaan fauna Peru, itu bermaksud kebebasan, kebanggaan negara, dan kepahlawanan. Kuartal kedua mempunyai pohon cinchona, kulitnya digunakan untuk membuat kina. Akhirnya, bahagian bawah perisai mempamerkan tongkat dari mana tumpahan syiling emas dan perak, yang melambangkan kekayaan mineral negara. Sebagai tambahan,garis putih bendera dikatakan mewakili kesucian, dan merah mengingatkan darah patriot. Seperti di sejumlah negara lain, bendera sipil yang dikibarkan oleh orang-orang swasta hanya menampilkan garis-garis, lambang itu disediakan untuk bendera yang berfungsi untuk tujuan rasmi (yaitu, pemerintah).